Here is a list of all functions with links to the structures/unions they belong to:

- g -

• gamma() : bm::bit_in< TDecoder >, bm::bit_out< TEncoder >
• gamma_arr_bit_block() : bm::serializer< BV >
• gamma_decoder() : bm::gamma_decoder< T, TBitIO >
• gamma_encoder() : bm::gamma_encoder< T, TBitIO >
• gamma_gap_array() : bm::serializer< BV >
• gamma_gap_bit_block() : bm::serializer< BV >
• gamma_gap_block() : bm::serializer< BV >
• gap_block_set() : bm::bvector< Alloc >
• gap_block_set_no_ret() : bm::bvector< Alloc >
• gap_length_serialization() : bm::serializer< BV >
• gap_op_to_bit() : bm::operation_functions< T >
• gap_operation() : bm::operation_functions< T >
• gap_transpose_engine() : bm::gap_transpose_engine< GT, BT, BLOCK_SIZE >
• gather() : bm::rsc_sparse_vector< Val, SV >, bm::sparse_vector< Val, BV >
• get() : bm::bit_grabber< T, BPC >, bm::bit_grabber< unsigned char, 8 >, bm::bit_grabber< unsigned short, 16 >, bm::bit_grabber< unsigned, 32 >, bm::bit_trans_grabber< T, BPC, BPS >, bm::bvps_addr_resolver< BV >, bm::compressed_collection< Value, BV >, bm::interval_enumerator< BV >, bm::rsc_sparse_vector< Val, SV >, bm::sparse_vector< Val, BV >, bm::str_sparse_vector< CharType, BV, STR_SIZE >::const_reference, bm::str_sparse_vector< CharType, BV, STR_SIZE >, bm::str_sparse_vector< CharType, BV, STR_SIZE >::reference, bm::sv_addr_resolver< SV >
• get_16() : bm::decoder, bm::decoder_little_endian
• get_24() : bm::decoder, bm::decoder_little_endian
• get_32() : bm::bitblock_get_adapter, bm::decoder, bm::decoder_little_endian, bm::decoder_range_adapter< DEC >
• get_32_AND() : bm::decoder, bm::decoder_little_endian
• get_32_OR() : bm::decoder, bm::decoder_little_endian
• get_48() : bm::decoder, bm::decoder_little_endian
• get_64() : bm::decoder, bm::decoder_little_endian
• get_8() : bm::decoder_base
• get_acc() : CSequenceColl
• get_aggregator_pipe() : bm::sparse_vector_scanner< SV, S_FACTOR >::pipeline< Opt >
• get_all_input_cnt_vect() : bm::aggregator< BV >::pipeline< Opt >
• get_all_input_vect() : bm::aggregator< BV >::pipeline< Opt >
• get_alloc_size() : bm::bv_arena_statistics
• get_allocator() : bm::bvector< Alloc >
• get_allocator_pool() : bm::base_sparse_vector< Val, BV, MAX_SIZE >, bm::basic_bmatrix< BV >, bm::bvector< Alloc >
• get_arg_block() : bm::aggregator< BV >
• get_args_vector() : bm::aggregator< BV >::pipeline< Opt >
• get_arr_bit() : bm::serial_stream_iterator< DEC, BLOCK_IDX >
• get_back_inserter() : bm::rsc_sparse_vector< Val, SV >, bm::sparse_vector< Val, BV >, bm::str_sparse_vector< CharType, BV, STR_SIZE >
• get_bcache() : bm::aggregator< BV >::pipeline< Opt >
• get_best_match_type() : bm::xor_scanner< BV >
• get_bit() : bm::bit_in< TDecoder >, bm::bvector< Alloc >, bm::serial_stream_iterator< DEC, BLOCK_IDX >
• get_bit_block() : bm::serial_stream_iterator< DEC, BLOCK_IDX >
• get_bit_block_AND() : bm::serial_stream_iterator< DEC, BLOCK_IDX >
• get_bit_block_ASSIGN() : bm::serial_stream_iterator< DEC, BLOCK_IDX >
• get_bit_block_COUNT() : bm::serial_stream_iterator< DEC, BLOCK_IDX >
• get_bit_block_COUNT_A() : bm::serial_stream_iterator< DEC, BLOCK_IDX >
• get_bit_block_COUNT_AND() : bm::serial_stream_iterator< DEC, BLOCK_IDX >
• get_bit_block_COUNT_B() : bm::serial_stream_iterator< DEC, BLOCK_IDX >
• get_bit_block_COUNT_OR() : bm::serial_stream_iterator< DEC, BLOCK_IDX >
• get_bit_block_COUNT_SUB_AB() : bm::serial_stream_iterator< DEC, BLOCK_IDX >
• get_bit_block_COUNT_SUB_BA() : bm::serial_stream_iterator< DEC, BLOCK_IDX >
• get_bit_block_COUNT_XOR() : bm::serial_stream_iterator< DEC, BLOCK_IDX >
• get_bit_block_OR() : bm::serial_stream_iterator< DEC, BLOCK_IDX >
• get_bit_block_SUB() : bm::serial_stream_iterator< DEC, BLOCK_IDX >
• get_bit_block_XOR() : bm::serial_stream_iterator< DEC, BLOCK_IDX >
• get_bits() : bm::bit_in< TDecoder >
• get_block() : bm::basic_bmatrix< BV >
• get_block_alloc() : bm::mem_alloc< BA, PA, APool >
• get_block_allocator() : bm::mem_alloc< BA, PA, APool >
• get_block_type() : bm::serial_stream_iterator< DEC, BLOCK_IDX >
• get_blocks_manager() : bm::bvector< Alloc >
• get_bmatrix() : bm::base_sparse_vector< Val, BV, MAX_SIZE >, bm::rsc_sparse_vector< Val, SV >
• get_buf() : bm::bvector_mini< A >, CSequenceColl
• get_buf_size() : CSequenceColl
• get_bv() : bm::bv_ref_vector< BV >
• get_bv_count_vector() : bm::aggregator< BV >::pipeline< Opt >, bm::sparse_vector_scanner< SV, S_FACTOR >::pipeline< Opt >
• get_bv_res_vector() : bm::aggregator< BV >::pipeline< Opt >, bm::sparse_vector_scanner< SV, S_FACTOR >::pipeline< Opt >
• get_bv_serializer() : bm::sparse_vector_serializer< SV >
• get_bv_zero() : bm::set2set_11_transform< SV >
• get_bvector() : bm::bvector< Alloc >::bulk_insert_iterator, bm::bvector< Alloc >::insert_iterator, bm::bvps_addr_resolver< BV >, bm::sv_addr_resolver< SV >
• get_bvector_alloc_pool() : bm::sparse_vector_scanner< SV, S_FACTOR >
• get_cache_gap_hits() : bm::aggregator< BV >
• get_compression_level() : bm::serializer< BV >
• get_compression_stat() : bm::serializer< BV >
• get_const_iterator() : bm::rsc_sparse_vector< Val, SV >, bm::sparse_vector< Val, BV >, bm::str_sparse_vector< CharType, BV, STR_SIZE >
• get_create_slice() : bm::base_sparse_vector< Val, BV, MAX_SIZE >, bm::rsc_sparse_vector< Val, SV >
• get_descr() : bm::xor_scanner< BV >
• get_enumerator() : bm::bvector< Alloc >
• get_first() : bm::bvector< Alloc >, bm::bvector_mini< A >, bm::similarity_descriptor< SO, DMD_SZ, IDX_VALUE, SValue, SFunc >
• get_first_idx() : bm::similarity_descriptor< SO, DMD_SZ, IDX_VALUE, SValue, SFunc >
• get_found_block() : bm::xor_scanner< BV >
• get_gap_block() : bm::serial_stream_iterator< DEC, BLOCK_IDX >
• get_group() : CSeqClusters
• get_h64() : bm::decoder_base
• get_half_octet() : bm::basic_bmatrix< BV >
• get_id() : bm::serial_stream_iterator< DEC, BLOCK_IDX >
• get_id_count() : bm::serial_stream_iterator< DEC, BLOCK_IDX >
• get_inv_arr() : bm::serial_stream_iterator< DEC, BLOCK_IDX >
• get_job_queue() : bm::thread_pool< QValue, Lock >
• get_kmer_union() : CSeqGroup
• get_lead() : CSeqGroup
• get_match_pairs() : bm::xor_scanner< BV >
• get_match_vector() : bm::xor_scanner< BV >
• get_members() : CSeqGroup
• get_min_len() : bm::sv_sample_index< SV >
• get_new_blocks_strat() : bm::bvector< Alloc >
• get_next() : bm::bvector< Alloc >, bm::bvector_mini< A >
• get_no_check() : bm::sparse_vector< Val, BV >
• get_null_bvect() : bm::base_sparse_vector< Val, BV, MAX_SIZE >, bm::sparse_vector< Val, BV >::back_insert_iterator
• get_null_bvector() : bm::base_sparse_vector< Val, BV, MAX_SIZE >, bm::rsc_sparse_vector< Val, SV >
• get_null_idx() : bm::basic_bmatrix< BV >
• get_null_support() : bm::base_sparse_vector< Val, BV, MAX_SIZE >
• get_octet() : bm::basic_bmatrix< BV >
• get_octet_matrix() : bm::str_sparse_vector< CharType, BV, STR_SIZE >::back_insert_iterator
• get_operation() : bm::aggregator< BV >
• get_operation_status() : bm::aggregator< BV >
• get_options() : bm::aggregator< BV >::pipeline< Opt >, bm::sparse_vector_scanner< SV, S_FACTOR >::pipeline< Opt >
• get_plane() : bm::sparse_vector_serial_layout< SV >
• get_pool() : bm::mem_alloc< BA, PA, APool >
• get_pos() : bm::decoder_base, bm::encoder
• get_ptr_allocator() : bm::mem_alloc< BA, PA, APool >
• get_ref_block() : bm::xor_scanner< BV >
• get_ref_vector() : bm::xor_scanner< BV >
• get_remap() : bm::str_sparse_vector< CharType, BV, STR_SIZE >::back_insert_iterator
• get_remap_buffer() : bm::rsc_sparse_vector< Val, SV >, bm::sparse_vector< Val, BV >, bm::str_sparse_vector< CharType, BV, STR_SIZE >
• get_remap_matrix() : bm::rsc_sparse_vector< Val, SV >, bm::sparse_vector< Val, BV >, bm::str_sparse_vector< CharType, BV, STR_SIZE >
• get_rep() : CSeqGroup
• get_row() : bm::basic_bmatrix< BV >
• get_row_idx() : bm::bv_ref_vector< BV >
• get_RS() : bm::rsc_sparse_vector< Val, SV >
• get_s_bc() : bm::xor_scanner< BV >
• get_s_block_best() : bm::xor_scanner< BV >
• get_s_block_stats() : bm::xor_scanner< BV >
• get_s_gc() : bm::xor_scanner< BV >
• get_second() : bm::similarity_descriptor< SO, DMD_SZ, IDX_VALUE, SValue, SFunc >
• get_second_idx() : bm::similarity_descriptor< SO, DMD_SZ, IDX_VALUE, SValue, SFunc >
• get_sequence() : CSequenceColl
• get_slice() : bm::base_sparse_vector< Val, BV, MAX_SIZE >, bm::rsc_sparse_vector< Val, SV >
• get_slice_mask() : bm::base_sparse_vector< Val, BV, MAX_SIZE >
• get_state() : bm::serial_stream_iterator< DEC, BLOCK_IDX >
• get_string_view() : bm::str_sparse_vector< CharType, BV, STR_SIZE >::const_iterator
• get_sv() : bm::rsc_sparse_vector< Val, SV >
• get_target() : bm::aggregator< BV >
• get_task() : bm::task_batch< BVAlloc >, bm::task_batch_base
• get_task_vector() : bm::task_batch< BVAlloc >
• get_temp_block() : bm::aggregator< BV >
• get_top_blocks() : bm::aggregator< BV >::pipeline< Opt >
• get_unsigned() : bm::sparse_vector< Val, BV >
• get_unsigned_bits() : bm::rsc_sparse_vector< Val, SV >, bm::sparse_vector< Val, BV >
• get_vector() : sparse_vect_index
• get_x_best_metric() : bm::xor_scanner< BV >
• get_xor_digest() : bm::xor_scanner< BV >
• GetVector() : DNA_FingerprintScanner
• go_first() : bm::bvector< Alloc >::enumerator
• go_to() : bm::bvector< Alloc >::enumerator, bm::interval_enumerator< BV >, bm::rsc_sparse_vector< Val, SV >::const_iterator, bm::sparse_vector< Val, BV >::const_iterator, bm::str_sparse_vector< CharType, BV, STR_SIZE >::const_iterator
• go_to_impl() : bm::interval_enumerator< BV >
• go_up() : bm::bvector< Alloc >::enumerator
• groups_size() : CSeqClusters
• gt_slice_limit() : bm::sparse_vector_scanner< SV, S_FACTOR >